Giovanni Battista Naldini (Fiesole, 1535-Florencia, 18 de febrero de 1591) fue un pintor italiano del manierismo tardío en Florencia.
Marchó a Roma durante unos meses en 1560 y fue llamado a Florencia hacia 1562 para trabajar a las órdenes de Giorgio Vasari en el Studiolo de Francisco I en el Palazzo Vecchio, en el que trabajó en labores menores durante cuatro años y más tarde, en 1570, en la pintura de dos de las piezas más logradas del conjunto: La alegoría del sueño y La recolección del ámbar.
Siguió los postulados manieristas imperantes, representados por artistas como Vasari, Agnolo Bronzino o Alessandro Allori, pero añadiendo una mayor expresividad en las figuras y un colorido más intenso que el de estos maestros.
Como su maestro Pontormo, fue un fiel seguidor del estilo de Andrea del Sarto.
Entre sus discípulos se encuentran Francesco Curradi, Valerio Marucelli y Domenico Passignano.