Cuando Ashikaga Takauji se rebeló contra el Emperador en 1335, el Príncipe Imperial regresa a la capital con Kitabatake Chikafusa, padre de Akiie, con el fin de derrotar a Takauji.
En 1339, el Príncipe Imperial Noriyoshi es nombrado príncipe heredero, y el 18 de septiembre del mismo año, a los 11 años, es nombrado el Emperador Go-Murakami, tras la abdicación de su padre.
La Corte del Sur tuvo que regresar a Yoshino, unos meses después.
En 1361, Hosokawa Kiyōji y Kusunoki Masanori, quienes se volvieron leales a la Corte del Sur, atacaron Kioto y recuperaron la ciudad temporalmente por 18 días, posteriormente Yoshiakira pudo recuperar la ciudad.
Las fuerzas de la Corte del Sur intentaron recuperar a Kioto, pero el poder de la Corte estaba debilitándose y empeoró tras la repentina muerte del Emperador Go-Murakami en 1368, a los 40 años.