Durante esta ocupación, el General Braxton Bragg intentó instalar al gobierno provisional como la autoridad permanente en la Commonwealth.
Sin embargo, el General Don Carlos Buell de la Unión realizó una emboscada en la ceremonia de la inauguración y condujo al gobierno provisional del estado por el tiempo final.
Richard Hawes fue elegido para reemplazar a Johnson, y sirvió por el resto de la guerra.
El estado tenía relaciones económicas fuertes con las ciudades aledañas al río Ohio, como por ejemplo Pittsburgh y Cincinnati mientras que a su vez compartían muchos vínculos culturales, sociales, y económicos con el Sur.
El historiador Allan Nevins interpretó que los resultados de las elecciones significan que la población de Kentucky se opuso fuertemente a la secesión y a la coerción contra los secesionistas.
[8] Como resultado del incendio en la fortaleza Sumter, el presidente Abraham Lincoln envió un telegrama al gobernador Magoffin pidiendo que la Commonwealth suministra cuatro regimientos como parte de la petición total de 75.000 tropas para la guerra.
[9] Magoffin, simpatizante hacia el Sur, contestó "Presidente Lincoln, Washington D.C., no enviaré hombre ni dólar alguno para el malintencionado propósito de someter a mi hermana región del Sur.
[11] En una elección del congreso especial llevó a cabo el 20 de junio, los candidatos unionistas ganaron nueve de los diez asientos del congreso por Kentucky.