Comprende dos grandes áreas pantanosas a lo largo de la orilla izquierda del río Danubio, el pantano Monostor y el Apatin, incluyendo 66 km del curso del Danubio (entre los kilómetros 1366-1433).
La primera designación como un área protegida se remonta al año 1955, cuando una zona de 10 km² fue propuesta como un importante hábitat para el pigargo europeo y el cigüeña negra.
Desde entonces, el área fue ampliada y el nivel de protección ha sido incrementado gradualmente.
Gornje Podunavlje fue designado como una reserva natural especial en 2001, con una superficie total de 19.648 ha.
Hay una importante biodiversidad en la reserva Gornje Podunavlje.