Guinea Ecuatorial estuvo representada en los Juegos Olímpicos de Sídney 2000 por cuatro deportistas, dos hombres y dos mujeres, que compitieron en dos deportes.
[1] El portador de la bandera en la ceremonia de apertura fue el nadador Éric Moussambani.
El equipo olímpico ecuatoguineano no obtuvo ninguna medalla en estos Juegos.
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