Gymnothorax viene del griego antiguo gymnos, "desnudo" y thorax, "tórax".
El epíteto específico javanicus se refiere a la isla indonesia de Java, donde esta morena vive comúnmente en sus arrecifes.
Se sabe que participa en la caza cooperativa con el mero coralino errante (Plectropomus pessuliferus).
[5] Una morena gigante madura tiene pocos depredadores naturales, aunque puede competir por el alimento con los tiburones que habitan en los arrecifes.
[6] Los lábridos limpiadores se encuentran comúnmente en su presencia, limpiando el interior de su boca.