En 1931 Hidroaviación fue relegado a la posición novena de la tabla acumulada.
Ante este hecho, el club participó en la liguilla de promoción para salvar la categoría junto con los clubes Circolo Sportivo Italiano, Lawn Tennis y el Ciclista Lima.
En la liguilla de promoción participaron los 4 mejores clubes de la División Intermedia 1931 que fueron: Juventud Perú, Sport Progreso, Miguel Grau y Sucre .
Sin embargo, para la temporada 1932 no se presentó y el equipo fue desactivado.
En el año 1932, el club se proclamó campeón de la Copa Uruguay al derrotar al Alianza Frigorífico Nacional por un marcador de 4 a 1.