[5] Las especies de los géneros Acentronura, Amphelikturus y Kyonemichtys parecen peces pipa, lo que explica por qué los caballos-pipa pigmeos a veces se agrupan en el subfamilia de los peces pipa Syngnathinae.
[6] Las especies del género Idiotropiscis son más parecidas a los caballitos de mar en apariencia teniendo cuerpo más profundo y tronco superior y crestas de la cola discontinuas.
[7] La subfamilia Hippocampinae es llamada así por su género Hippocampus, palabra derivada del griego clásico ἱππόκαμπος (hippokampos), una palabra compuesta de las voces ἵππος, "caballo" y κάμπος, "monstruo marino".
[8] Otros nombres comunes que se han aplicado a los caballos-pipa pigmeos aunque desaconsejados por su inexactitud son: "caballito de mar bastardo", "peces pipa pequeños" y "dragón pipa pigmeo".
Debido a la naturaleza morfológicamente intermedia de los caballos-pipa pigmeos entre peces pipa y caballitos de mar, la colocación taxonómica de este grupo sigue siendo polémica, y se han propuesto al menos tres clasificaciones diferentes para la subfamilia Hippocampinae.