El explorador español Álvaro de Saavedra Cerón desembarcó ahí en 1528 y las conquistó.
Quedaron encuadradas en el Virreinato de Nueva España junto con las Filipinas.
España no desarrolló una ocupación y colonización formal de estas islas durante los siglos XVI-XIX, salvo por algunos efímeros intentos misionales católicos (documentados en 1668 y 1731).
Las islas firmaron un tratado de asociación con los Estados Unidos en 1986 y hasta 1999 los isleños recibieron US$180M por el uso del atolón de Kwajalein, US$250M en compensación por las pruebas nucleares, y $600m en otros pagos contemplados en el pacto.
A pesar de la constitución, el gobierno fue ampliamente controlado por los jefes tradicionales.