La institución religiosa fue posteriormente protegida y beneficiada por el rey Roger II de Sicilia.
En 1682, los considerables legados e ingresos permitieron el deseo de poseer un templo aún más suntuoso, ennoblecido por la entrada directa al Cassaro, por lo que las monjas decidieron una nueva ampliación, confiando el proyecto a Paolo Amato.
Las obras comenzaron inmediatamente, durante la excavación de los cimientos se encontraron numerosos hallazgos arqueológicos, principalmente monedas.
Asistido por el alumno maestro de obras Giacomo Amato, siguió personalmente la construcción hasta 1685, año en el que se hizo cargo el jesuita Angelo Italia.
En 1689 Angelo Italia fue reemplazado nuevamente por Paolo Amato, quien creó las dos capillas mayores en los extremos del eje menor de la iglesia, la pequeña cúpula en el presbiterio y en 1694 la cúpula central, la logia y los nichos en la fachada.
En 1704 se consagró la iglesia, pero faltaba gran parte de la decoración interna, realizada a lo largo del siglo XVIII.
En 1721 Giacomo Amato diseñó junto con Gaetano Lazzara el altar mayor de la iglesia, que luego fue destruido.
El aspecto actual del edificio, sin embargo, difiere considerablemente del normando, ya que las formas, ya remodeladas en el siglo XVI, se volvieron plenamente barrocas con el encargo al arquitecto Paolo Amato, que adoptó el modelo de planta central.
El proyecto concebido por Paolo Amato resulta del injerto de una cruz griega en un vasto dodecágono irregular inscrito en una elipse.
Pero lo que más sorprende es el suntuoso interior, enteramente decorado con mármoles policromados, estucos y frescos.
del XIX secolo) escribe que el Santissimo Salvatore "... tiene forma elíptica, cubierta por una altísima cúpula cuyo cuadro representando el Paraíso es una magnífica obra del caballero de Palermo Vito D'Anna realizada en 1765, último año de su vida..."
El convento contiguo sufrió una destrucción casi total tras los bombardeos de la última guerra mundial.