Nació en el año 1889, en Ramos Arizpe, Coahuila.
Cuando en febrero de 1913 es asesinado Francisco I. Madero por Victoriano Huerta, Ignacio Flores se afilia a la revolución constitucionalista con el grado de capitán segundo bajo las órdenes del general Francisco Coss; ese mismo año fue ascendido a capitán primero.
Ese año fue decisivo para su carrera militar, ya que obtuvo los grados de teniente coronel y coronel.
Fue asistente del General de División Matias Ramos Santos cuando este fue nombrado comandante de la 5.ª jefatura de operaciones militares con cuartel general en Chihuahua, Chih.
para encabezar la defensa de Ciudad Juárez, durante la asonada militar escobarista en 1929.