Incompatibilidad cruzada

No obstante, el crecimiento de los tubos polínicos puede ser detenido en algún punto entre el estigma y los óvulos, de modo que la fecundación no se lleva a cabo.

[3]​ Existe una relación entre la autoincompatibilidad y el fenómeno de incompatibilidad cruzada.

Así, en general, los cruzamientos entre individuos de una especie autocompatible (AC) con individuos de una especie autoincompatible (AI) dan descendencia híbrida.

Por el contrario, el cruzamiento recíproco (o sea, hembra AI x macho AC) no produce descendencia debido a que los tubos polínicos no logran llegar hasta los óvulos.

Este fenómeno se conoce como incompatibilidad unilateral, el cual ocurre, además, cuando se cruzan dos especies AC o dos especies AI entre sí.