La flor está protegida por dos espatas, ambas redondas en sección transversal.
El color de las flores es variable: el amarillo y el púrpura o violeta son los más comunes, pero también las hay azules, colores crema o blanco.
A veces encontramos colores mezclados, aunque las caracteriza una mancha oscura en la parte inferior.
Desde mediados del siglo XX, el iris pumila se cultiva abundantemente en jardinería, dando lugar a una gran variedad de modernos lirios enanos.
Otro pumila híbrido es el Iris coerulea, llamado así por Édouard Spach en la Hist.