Al igual que sus predecesores, Jak 3 toma lugar en un universo sin nombre ficticio creado por Naughty Dog.
Ya no veremos una ciudad ajetreada, rica en vegetación en algunas zonas, y con naves por todas partes.
Aullador del desierto: Coche resistente que cuenta con dos metralletas montadas al frente.
Eficaz si te encuentras frente a una gran cantidad de enemigos.
Fase 3 RPG plasmita: Lanza granadas bastante mortíferas que consumen 10 de munición roja.
Fase 2 Reflector de Rayos: Las balas de la bláster ahora rebotan en paredes y obstáculos, haciendo que sea impredecible y muy mortífera para los enemigos Fase 3 lanzador giratorio: Se lanza un disco giratorio que dispara en círculo hasta 50 balas y se puede detener si se desea.
Fase 1 Furia volcánica: Ametralladora con gran cadencia de disparo, eleva a los enemigos que alcanza.
Fase 2 Empuñadura del arco: Lanza un haz de electricidad que abrasa a los enemigos.
Fase 3 Pinchador: Las balas de la furia volcánica ahora rastrean enemigos.
Cuando llegan por primera vez a Villa Refugio, Jak es capturado por la Guardia Carmesí y se convierte en el proyecto "Guerrero Oscuro" del Barón Praxis durante dos años.
Daxter fue un humano que debido a un accidente se transformó en un híbrido de nutria-comadreja (Precursor).
Cuando Jak y Daxter la encuentran, les revela que durante dos años ha estado trabajando en el medio de volver a su tiempo construyendo una réplica de la máquina que les llevó a la ciudad.
Fiero guerrero y hábil estratega, luchará hasta poner fin a la guerra de Villa Refugio.
Sig es ciudadano de Spargus mandado por el Rey Damas como espía a Villa Refugio, estuvo en dos oportunidades con Jak y Daxter combatiendo Cabezachapas.
Además, también ansía conocer a los Precursor hasta que se convierte en uno de ellos por ellos mismos como castigo.
Tras perder una carrera contra Jak en el circuito, sufre un accidente al estrellarse contra barriles de una sustancia peligrosa (Eco Oscuro), al intentar atropellar a Jak, en el que su cuerpo es destrozado (destruido, casi desintegrado) para finalmente ser sustituido por metal.
Tras esta desgracia solo quiere tomar control/acabar con la vida en la tierra y más aún con Jak.
En 2006, se lanzó Daxter, la historia de su fiel compañero que narra como lo estuvo buscando durante los 2 años intermedios entre Jak and Daxter: The Precursor Legacy y Jak II: Renegade.
Un misterioso dúo con una máquina especial crea una realidad extraña en donde se encuentran los tres planetas unidos.
Ahora los personajes se encuentran en una gran batalla para poder salvar sus planetas y en una lucha por su supervivencia.
Tras estos 2 últimos juegos (considerados un fracaso por parte de los fanes) en una entrevista sobre Uncharted 3: Drake's Deception, el director ejecutivo señaló que se estaba trabajando en un recopiltatorio HD para PS3 de los 3 primeros juego que contara con soporte 3D y compatibilidad con Playstation Move.