Su nombre completo era Francisco Javier María Acisclo.
Su padre, Javier Los Arcos Pérez, había ocupado la alcaldía de Sangüesa en varias ocasiones y fue candidato a diputado provincial.
Su madre se llamaba Teresa Miranda Zabalgaray.
En 1890 fue elegido académico de la Real Academia de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, y tomó posesión en 1891 con el discurso Aplicaciones de las Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, al arte de las guerras.
De su matrimonio, con bastante probabilidad en segundas nupcias, con Brígida Blanco Barbería, natural de Irurozqui, tuvieron cinco hijos: Javier, Manuel, Tomás, Emiliano y José María.