Asistió a la escuela secundaria en la Ngora High School.
Jeje Odongo fue capturado poco después del primer operativo del Ejército de Resistencia Nacional (NRA, National Resistance Army) y encarcelado en la Cárcel de Máxima Seguridad de Luzira.
En 1996, fue seleccionado para reemplazar al coronel Sserwanga Lwanga como comisario político en las Fuerzas de Defensa del Pueblo de Uganda (UPDF).
En 1998, renunció a su escaño parlamentario y a su puesto en el gabinete y fue nombrado comandante del Ejército, reemplazando al mayor general Mugisha Muntu.
Se desempeñó como comandante del ejército hasta 2001, cuando fue reemplazado por el mayor general James Kazini.