Empezó su carrera futbolística en el equipo militar en el año 2006, se formó e hizo todas las formativas en El Nacional, la sub-14, la sub-16, la sub-18 y posteriormente la reserva.
[2] En 2011 fue transferido a Sociedad Deportiva Aucas para jugar la Segunda Categoría de ese año,[3] sin conseguir el ascenso al final.
[11] En 2018 es fichado por el subcampeón de la temporada anterior, el equipo manabita de Delfín Sporting Club,[12] para disputar el torneo nacional y la Copa Libertadores 2018, con el cetáceo en total jugó 45 encuentros y marcó un gol a Técnico Universitario.
[19] Para 2020 es fichado por Atlético Porteño que disputó la Serie B en ese año.
[20] Es hermano del también futbolista Wilmer Godoy, que pasó por varios clubes de Ecuador entre ellos Universidad Católica y Emelec.