Fue parlamentario vasco (1980-1986), primero por Unión de Centro Democrático (UCD) y posteriormente por la coalición AP-PDP-PL.
Hijo del médico Jacinto Aguinaga Munarriz, y de Felisa Torrano.
Aguinaga sale elegido, siendo uno de los seis parlamentarios centristas durante la I Legislatura del Parlamento Vasco (1980-1984).
En ese momento se produce su acercamiento al Partido Demócrata Popular (PDP), un partido democristiano escindido medio año antes de la UCD, liderado por Oscar Alzaga y coaligado en aquel momento con Alianza Popular.
Aguinaga permaneció en el cargo hasta octubre de 1986, cuando la crisis interna del PNV, partido en el Gobierno Vasco, forzó el adelanto electoral.