Naber nació en Haarlem en una familia neerlandesa acomodada e intelectual.
Durante un corto periodo fue la Segunda Secretaria Asistente de la organización, pero se vio obligada a renunciar debido a sus compromisos como historiadora y autora.
Durante la década de 1890, comenzó a publicar sobre importantes figuras históricas femeninas.
Durante su vida publicó muchas biografías de mujeres notables, así como trabajos sobre los inicios del movimiento neerlandés de mujeres en el siglo XIX.
Naar hare brieven (1921) una biografía de la feminista y autora sueca Frederika Bremer basada en sus cartas.
En 1935 colaboró con las feministas neerlandesas Willemijn Posthumus-van der Goot y Rosa Manus para crear los Archivos Internacionales para el Movimiento de Mujeres (IAV), ahora conocido como Atria, instituto del conocimiento para la emancipación y la historia de las mujeres .