Su próximo destino lo llevó a Marine Barracks, división octava y primera en Washington D.C, donde se trabajó en el Instituto del Cuerpo de Marines y como Oficial Ceremonial.
Él, posteriormente sirvió como miembro del Cuerpo de la Marina en el Centro de Estudios Estratégicos e Internacionales (CSIS).
Durante este período, recibió el Trofeo de Liderazgo Leftwich.
Los correos entre Kelly y Allen salieron a la luz cuando el FBI investigó las acusaciones de Kelly, de que recibió correos electrónicos anónimos que la amenazaban por su relación con Petraeus.
Esos correos llevaron al FBI a revelar una aventura extramatrimonial entre David Petraeus y su biógrafa, Paula Broadwell.
En 1990, recibió el Premio William P. Clements como instructor militar por su trayectoria.