En su última temporada con el filial disputó un partido en la Primera división española con el primer equipo de la Real Sociedad.
Sin embargo, logró asentarse en el equipo como defensa central y jugó durante la mayor parte de su carrera en ese puesto.
En la temporada 2001-02, sufrió una aparente y sorpresiva bajada en su rendimiento, perdió la confianza del entrenador John Benjamin Toshack, el mismo que le había hecho debutar en 1992, y quedó prácticamente apartado del equipo, jugando poco más de 150 minutos en toda la temporada.
Al finalizar la temporada el jugador anunció que se retiraba del fútbol profesional, con 32 años de edad.
El club alabó siempre la profesionalidad del jugador, aún en las temporadas que apenas jugó.
El bagaje de Pikabea se resume en 11 temporadas en la Primera división española jugando siempre con la Real Sociedad.