Su formación se produjo en otros equipos del fútbol vasco como el Deportivo Alavés y la Cultural de Durango.
La temporada 1988-89 fichó por el Sestao Sport Club, equipo de la Segunda División Española.
En total jugó 74 encuentros con la Real, de los que 64 fueron en la Primera División Española.
Sus mejores resultados fueron 2 clasificaciones para la Copa de la UEFA, en las temporadas 1989-90 y 1991-92, aunque no llegó a debutar en esta competición.
Fue la vez que el equipo pacense estuvo más cerca de ascender a Primera División.
Agirre no consiguió reponerse de su grave lesión y pasó la temporada 1996-97 en blanco, sin jugar un solo partido.