Su formación se produjo en otros equipos del fútbol vasco como el Deportivo Alavés y la Cultural de Durango.
La temporada 1988-89 fichó por el Sestao Sport Club, equipo de la Segunda División Española.
Aguirre militó durante 5 temporadas y media en la Real, donde siempre fue un suplente.
Sus mejores resultados fueron 2 clasificaciones para la Copa de la UEFA, en las temporadas 1989-90 y 1991-92, aunque no llegó a debutar en esta competición.
Fue la vez que el equipo pacense estuvo más cerca de ascender a Primera División.
Agirre no consiguió reponerse de su grave lesión y pasó la temporada 1996-97 en blanco, sin jugar un solo partido.