Entre sus doscientas composiciones se encuentran oratorios (en particular "Christoforus" y "Monfort"); dos óperas cantatas para soli, coro y orquesta ("La estrella de Belén", "Toggenburg", "Klãrchen auf Eberstein", etc.); obras más pequeñas para coro y orquesta; sinfonías ("Wallenstein"), oberturas y música de cámara para varias combinaciones de instrumentos.
Joseph Renner, Jr., ha remediado recientemente la mayoría de estos defectos e hizo que las misas estén disponibles para fines litúrgicos.
Josef Rheinberger fue enterrado en el Antiguo Cementerio del Sur de Múnich.
Los restos mortales de Rheinberger y su esposa descansan allí desde 1989 en una tumba honorífica.
Una lápida en el Antiguo Cementerio del Sur de Múnich recuerda a Josef y Franziska Rheinberger.