Actualmente es profesor de derecho procesal administrativo y teoría del acto administrativo y procesos contenciosos en la Universidad Javeriana, así como conjuez del Consejo de Estado.
Entre 1989 y 1997, trabajo con su padre, el exconsejero de Estado Carlos Galindo Pinilla, en su despacho Galindo y Asociados, para que tiempo después Juan Carlos Galindo abriera el suyo propio.
Después fue procurador cuarto delegado ante la Sección Tercera del Consejo de Estado (2001-2002), procurador séptimo delegado ante la Sección Quinta del Consejo de Estado (2002-2006), y Conjuez de la Sección Quinta del Consejo de Estado (2024).
Como docente, en la Facultad de Ciencias Jurídicas de la Pontificia Universidad Javeriana se ha desempeñado como profesor de cátedra en Historia Universal del Derecho, Derecho Administrativo, Derecho Procesal Administrativo.
Así mismo, fue director de la maestría de Derecho de Seguros en la misma universidad, donde dictaba Teoría del Acto Administrativo y Procesos Contenciosos.