Juan Federico fue liberado y se vio obligado a adoptar el título menor de duque de Sajonia en una zona substancialmente menor que sus anteriores tierras en Turingia.
El plan de partición también estipulaba que los dos hermanos debían intercambiar sus regiones entre ellos cada tres años.
Sin embargo, Juan Guillermo pronto cayó en desgracia ante el emperador, cuando entró al servicio del rey Carlos IX de Francia como un general en su campaña contra los hugonotes (los reyes franceses fueron los enemigos de los emperadores Habsburgo).
El emperador usó a los dos hijos supervivientes de Juan Federico II contra Juan Guillermo, y en 1572 se llegó a la partición de Erfurt.
Juan Guillermo retuvo sólo la parte menor del ducado, la región alrededor de Weimar, pero añadió los distritos de Altenburg, Gotha, y Meiningen a sus territorios.