[2][3] Ha ido creciendo desde su creación en el año 2013, cuando partió como una opción a Transbank, para luego afianzarse como una alternativa segura, reconocida incluso en con el Premio Nacional de Innovación (Avonni) en 2016, principalmente por la seguridad de las transacciones.
Durante el 2013 se sumó Luís Hernán Paúl, como inversionista ángel y miembro del directorio.
[1] El nombre khipu proviene de la palabra "Quipu", o nudo en quechua, que fue una herramienta utilizada por los incas para llevar el registro y la contabilidad.
En 2021, BancoEstado impidió que sus clientes usarán este sistema para pagar en los comercios online, debido a una política de seguridad del banco que prohíbe las automatizaciones en su sistema.
[5] Khipu implemento medidas tecnológicas para impedir el bloqueo de clientes de Banco Estado, y volvió a operar normalmente con dicho banco al poco tiempo.