[3] En septiembre de 2012 firmó un nuevo contrato con el Schalke que lo mantendría en el club hasta 2016.
Las noticias llegaron como otro golpe, pues sus problemas recurrentes de rodilla lo restringieron a solo cuatro apariciones en la temporada 2013-14.
Tras 20 partidos y 4 goles en la temporada 2014-15, el Bayer Leverkusen ficharía al jugador que firmaría hasta 2020 con el conjunto alemán.
[8] Tras lograr con su equipo el objetivo de la permanencia en la Bundesliga, firmaría con el Hamburgo un contrato hasta 2020.
A pesar del descenso Papadopoulos seguiría en el equipo pero las continuas lesiones de rodilla solo le permitirían jugar cuatro encuentros en las dos próximas temporadas, abandonando el club en verano de 2020 tras finalizar contrato.
Papadopoulos anotaría su primer gol con la selección en el minuto 26 de este mismo encuentro, poniendo momentáneamente el 2-0 en el marcador.
Su segundo gol la selección lo marcó ante Letonia el 6 de septiembre del mismo año.