Está operado por los Ferrocarriles Federales Suizos (SBB CFF FFS) y la SNCF.
Los inicios del servicio nacen al calor del proyecto 'CEVA' ( Cornavin - Eaux-Vives - Annemasse), que pretendía una reconstrucción y modernización del entramado de líneas y ramales que conectaban Ginebra con Annemasse, el corazón de la conurbación, para transformarlos en una única línea de alta capacidad y adaptada a las necesidades actuales para implantar un servicio de alta frecuencia de viajeros entre la ciudad suiza y la francesa.
Mientras este proyecto se definía y materializaba, en 1994 comenzaron las operaciones de un servicio de trenes cadenciados entre Ginebra-Cornavin y Bellegarde-sur-Valserine, denominados originalmente Rhône Express Régional y explotado por los Ferrocarriles Federales Suizos (SBB-CFF-FFS) en colaboración con la SNCF.
Posteriormente, perdieron esa marca y pasaron a operarse como trenes Regio, además de añadir un nuevo trayecto desde 2002, entre Coppet y Lancy-Pont-Rouge, aprovechando la inauguración de esta estación y la renovación del tramo hasta Ginebra-Cornavin.
En diciembre de 2019 fue inaugurado oficialmente el servicio Léman Express, con la apertura al completo de la línea CEVA.