La línea 498, en sus orígenes, se dividía en 4 sublíneas, las cuales serían: La fusión de las líneas 498B y 498C en 2007, dieron lugar a la actual línea 499.
Asimismo, en 2013 la línea 498 quedó recortada a Moraleja de Enmedio.
El servicio al Hospital de Fuenlabrada quedó absorbido por la línea 496, que también sufrió un recorte, trasladando su cabecera del Centro Comercial Parquesur en Leganés al hospital anteriormente mencionado.
También tenía expediciones directas Móstoles-Xanadú, que se separaron desde el 5 de julio de 2021, formando la línea 498A.
También desde ese día se sitúa la nueva cabecera en la Avenida Abogados de Atocha, pero los servicios nocturnos mantienen la cabecera de Móstoles Central.