En la Cumbre Ibérica se decidió que el instituto tendría como primer director un investigador español y debería llegar a contar con unos 200 investigadores de España, Portugal y otros países con un presupuesto anual de unos 30 millones de € y una inversión inicial de igual valor, pagados a partes iguales por ambos países, siendo financiado el resto por la Unión Europea.
[2] Con la creación de este instituto se pretende reforzar la colaboración científica y tecnológica entre España y Portugal.
En una primera fase el instituto estaría abierto sólo a los países ibéricos para luego dar paso a la entrada de instituciones y especialistas de todo el mundo, con el objetivo de crear un polo de investigación internacional de excelencia.
El INL (por sus siglas en inglés) fue inaugurado el 18 de julio de 2009 por el rey Juan Carlos I de España y su primer director es el catedrático gallego José Rivas.
[3] Cerca de 200 investigadores trabajan en el Instituto en cuatro áreas principales: nanomedicina, nanoelectrónica, vigilancia medioambiental y control de seguridad y calidad alimentaria y nanomáquinas y nanomanipulación.