La laguna está geológicamente catalogada como maar de San Diego por el Servicio Geológico Colombiano, mientras que el cono volcánico adyacente está clasificado como estratovolcán.
De igual forma en la parte sur se evidencia un pequeño cono adventicio.
Si bien su condición es estable, esporádicamente se observan emisiones gaseosas en la laguna.
En 2013 se instaló una estación sismológica, con miras a dar seguimiento a su actividad y determinar si es un volcán activo.
[2] En 2013, durante investigaciones sobre su actividad, fue descubierto el cercano volcán El Escondido.