La Laguna de Santiaguillo está formada por dos grandes vasos denominados superior e inferior.
Los arroyos que más aportan agua son los ubicados en la región norte.
Entre los ejidos aledaños a la Laguna se encuentran: Miguel Negrete, Dr. Castillo Valle, San Miguel de Allende, San José de Morillitos, Melchor Ocampo, Fuente del Llano, La Escondida, Libertadores del Llano, Guatimapé, Guillermo Prieto, Chapala, J. Cruz Gálvez, Los Lirios, Miguel Hidalgo, Arnulfo R. Gómez y La Soledad.
; en sitios propensos a inundaciones y con drenaje deficiente son comunes algunas especies de los géneros Eleocharis, Carex, Cyperus, Echinochloa, Sporobolus, Allium, Mimulus, Eryngium, entre otras.
En zonas de agua corriente son comunes Mimulus cardinalis, Lobelia laxiflora, Begonia gracilis, Ranunculus trichophyllus, Polygonum sp., y Juncus spp.
En el caso de los anfibios y reptiles se registran 26 especies entre ambos grupos.
Lázaro Cárdenas, se expropió la tierra de las antiguas haciendas, convirtiéndolas en ejidos.
Como Objetivos Específicos del Programa de Manejo, se mencionan los siguientes: