Allí debutó oficialmente a los 14 años, durante la participación del Torneo Argentino B 2006/07.
El primero en la fecha 3 contra All Boys donde solo jugó 45 minutos y su equipo perdió 2-0.
El segundo fue por la fecha 6 en la victoria 3-1 contra Olimpo de Bahía Blanca, donde jugó los 90 minutos.
Este sería el primer partido de un gran año para Marín, donde jugó 7 partidos en el Torneo Final 2013, uno por Copa Argentina 2013 y 5 en la susodicha Copa Libertadores, demostrando estar en las consideraciones del director técnico.
En el Torneo Inicial 2013 disputó los primeros 4 partidos del campeonato pero su mal rendimiento lo llevó a ser suplente.
Ya en el año 2015, el futbolista comenzó de una manera no muy feliz el nuevo calendario: en un partido amistoso frente a Racing Club, jugado en Mar del Plata, Boca fue vapuleado por 4-1 y Marín fue expulsado a los 28' por una violenta infracción contra Ricardo Centurión (que a la postre, desembarcaría en Boca Juniors al año siguiente).
El Xeneize quedaría eliminado tras la suspensión del partido de vuelta en un recordado y bochornoso incidente.
A principios del año 2016, Marín es cedido al Club Atlético Tigre por seis meses, donde apenas disputó 11 partidos oficiales, sin goles anotados, ni actuaciones brillantes.
A partir de este encuentro, el lateral se afirmó como titular del equipo.