La clasificación de esta familia es un problema abierto y su relación con otras lenguas Níger-Congo todavía divide a los expertos.
Durante el siglo XX se llevaron a cabo numerosos trabajos de campo en los montes Nuba.
[5] Todos estos trabajos ampliaron notablemente el conocimiento que se tenía a principios del siglo XX de estas lenguas.
Gradualmente a lo largo del siglo XX, la extensión de las lenguas kordofanas, sus características gramaticales, el léxico, y las relaciones entre ellas se fueron conociendo mejor.
Algunos autores han propuesto dos supergrupos talodi-heiban y rashad-katla, siendo el segundo más dudoso que el primero.