Al igual que muchos adolescentes a su edad, llevaba aparato de dientes.
Más tarde, un grupo de jóvenes se reunieron en el bosque para beber y consolarse unos a otros.
Sola, Mahaffy caminó hasta un teléfono público en Macs Milk y llamó a la casa del mismo amigo en donde había permanecido los días anteriores.
Le pidió poder pasar la noche ahí, pero debido a las altas hora de la noche su amigo le dijo que no, ya que eso implicaría despertar a sus padres.
Su familia estaba preocupada cuando vieron que no estaba en su casa la mañana del sábado 15 de junio.
Cuando Mahaffy no se presentó al funeral de su amigo Chris Evans y los tres adolescentes muertos con él, su madre llamó a la policía.
El 18 de junio, Debbie Mahaffy presentó la documentación oficial para que su hija figurase como desaparecida.
Ya en el coche, ella se sentó en el asiento del copiloto con los pies afuera y, al cabo de un rato, Bernardo le cubrió la cabeza rápidamente con su sudadera, la obligó a entrar al vehículo y la llevó a su casa de Port Dalhousie, donde Karla Homolka estaba durmiendo.
Según Homolka, Bernardo la estranguló con un cable eléctrico una segunda vez cuando el primer intento la dejó inconsciente durante unos minutos.
Homolka, técnica veterinaria, tenía acceso a fármacos sedantes que usaron para someter a Mahaffy, la misma técnica que la pareja utilizó en la violación de la hermana de Homolka hacía seis meses.
La versión de Bernardo afirma que ella no lo ayudó a lavar y embolsar las partes del cuerpo.
Los investigadores creyeron inmediatamente que había sido violada y torturada, algo que se confirmó cuando se encontraron las cintas de vídeo en el hogar de Bernardo y Homolka.