El Gobierno comunicará a aquella Municipalidad el Plan de Estudios y las demás disposiciones para que, cuanto antes, tenga efecto lo determinado en este decreto.
[5] A pesar de ya haber sido fundado, el Liceo no pudo iniciar sus actividades hasta solucionar una interpretación errónea del decreto fundacional: no se tenía claridad si los profesores debían ser necesariamente religiosos franciscanos, siendo estos tan pocos que apenas bastaban para cumplir los trabajos propios del convento.
En 1893, cuando era rector don José Mercedes Oñat (1891-1895), las instalaciones del Liceo se comenzaron a demoler para construir un nuevo edificio en el mismo lugar.
Este hito permitió contar con un moderno establecimiento para la época, elevar la calidad de enseñanza y convertirse en un orgullo para la ciudad.
[8] El año 2010, Cauquenes vuelve a ser afectado por un terremoto de gran intensidad, y el Liceo queda con graves problemas estructurales, lo que provoca que el año escolar no se pueda iniciar.
[10] El himno del Liceo fue creado por Jacinto Larraguibel y Juan Meza Becerra.
Con el libro estudio y constancia En las aulas de un templo escolar, Así vamos forjando con ansias, En la mente el más noble ideal.
De las aulas iremos un día A los campos, tribuna o taller Y sabremos cumplir con hombría Por más duro que sea el deber.