División de Honor Femenina 1998-99

El Oroquieta Villaverde se hizo con la tercera y última liga de su historia.

El campeonato fue organizado por la Real Federación Española de Fútbol.

En la primera fase tomaron parte 50 equipos, repartidos en cuatro grupos, siguiendo criterios de proximidad geográfica.

La clasificación final se estableció con arreglo a los puntos obtenidos en cada enfrentamiento, a razón de tres por partido ganado, uno por empatado y ninguno en caso de derrota.

La fase final de disputó en mayo en Burgos.