La competición se disputó bajo el sistema de eliminación directa, en dos ruedas.
El equipo que resultase campeón de este "mini torneo" clasificaría directamente a la Copa Libertadores, en su fase previa, mientras que el equipo perdedor de la final gana un cupo para la Copa Sudamericana 2014, en la misma fase.
[1][2] La competencia fue ganada por la Universidad de Chile, quien superó a Deportes Iquique en la final de ésta por un marcador global de 5-0, y selló su cupo para la Copa Libertadores 2014, mientras que Deportes Iquique consiguió un cupo para la Copa Sudamericana del mismo año.
Los equipos clasificados a la Liguilla fueron los que terminaron en los puestos del segundo al quinto en el Torneo Apertura 2013.
Unión Española, que finalizó el torneo en el tercer lugar, no jugó la liguilla por estar previamente clasificada a la Copa Libertadores 2014 al ser campeón del Torneo Transición 2013, y debido al reglamento un equipo no puede participar en 2 torneos el mismo año.