Es el futbolista que más partidos disputó con la camiseta del Cartero en toda su historia, vistiéndola 500 veces y convirtiendo 50 goles, estando entre los 5 máximos artilleros de la institución.
Tuvo tres ciclos en el Cartero, arribó en el 2004, en un Torneo Apertura donde se ubicaron últimos en la tabla.
Sin embargo, tras vencer en cancha de Español 1 a 0, el club perdió en un polémico partido en el Bajo Flores y se quedó sin el ascenso.
Asegurando el carril izquierdo defensiva y ofensivamente, Banegas se afianzó convirtiéndose en un referente en el plantel.
En el primer semestre de la temporada 2012/13 jugó todos los partidos, 18 en total marcando 1 gol (a Huracán).