Era el tercer hijo varón del Príncipe Carlos Jorge Lebrecht de Anhalt-Köthen, y de su esposa Luisa Carlota, hija del Duque Federico de Schleswig-Holstein-Sonderburg-Glücksburg.
Iniciándose en 1798 fue Mayor en el Regimiento del Rey en el servicio danés, donde recibió su entrenamiento militar.
En 1801, renunció al servicio danés y se pasó al servicio prusiano.
La muerte de su hermano Carlos Guillermo en 1793 hizo de Luis el siguiente en la línea de sucesión de Anhalt-Köthen, precedido solo por su hermano mayor Augusto Cristián Federico.
Su temprana muerte impidió que finalmente heredara Köthen, pero su hijo Luis Augusto sucedió a su tío en Anhalt-Köthen cuando este murió diez años más tarde.