Al finalizar la Segunda Guerra Mundial, las Fuerzas Aliadas ocuparon el territorio alemán, y ordenaron la disolución de todas las organizaciones en Alemania, incluyendo las deportivas, por lo que el club fue refundado como SSV Ingolstadt 1881; y regresaron a su nombre original en 1948.
En 1946 clasificaron a la Landesliga Bayern (II), liga que sufrió por la división de la Oberliga (I) en norte y sur.
En 1963 nace la Bundesliga, con lo que hay cambios en el fútbol alemán, originando tres nuevas Landesligas, donde el MTV fue ubicado en la Bayern-Sur, donde descendieron a la Bezirksliga Oberbayern-Nord (V).
En el año 2009 la sección de fútbol fue refundada en la C-Klasse Donau-Isar (XIII), logrando constantes ascensos hasta llegar a la décima categoría, mientras que el ESV Ingolstadt desapareció por razones financieras,[13] las cuales fueron la principal razón para aceptar la fusión.
El club cuenta actualmente con 16 secciones (no todas deportivas), las cuales son: Basketball, voleibol de playa, esgrima, fútbol, fisicoculturismo, balonmano, judo, karate, kobudo, atletismo, lucha olímpica, ajedrez, esquí, tenis, tenis de mesa, gimnasia, voleibol, Schäfflergilde (baile tradicional) y Drama.