Magdalena Sibila de Sajonia-Weissenfels (3 de septiembre de 1673 - 28 de noviembre de 1726) fue una mujer noble alemana miembro de la Casa de Wettin (línea Albertina) y por matrimonio duquesa de Sajonia-Eisenach.
Nacida en Halle, era la hija mayor y el primer hijo del duque Juan Adolfo I de Sajonia-Weissenfels y su esposa Juana Magdalena, hija del duque Federico Guillermo II de Sajonia-Altenburgo.
Fue nombrada en honor a su bisabuela paterna, la duquesa Magdalena Sibila de Prusia.
En Weissenfels, el 28 de julio de 1708, Magdalene Sibylle se casó con Juan Guillermo III, duque de Sajonia-Eisenach, como su tercera esposa.
Tuvieron tres hijos, de los cuales solo uno sobrevivió a la edad adulta: Murió en Eisenach a los 53 años y fue enterrada en Georgenkirche, Eisenach.