Más tarde escribió una de las primeras versiones del software MediaWiki en el cual funciona Wikipedia.
[3] Trabaja en Cambridge con el Instituto Wellcome Trust Sanger desde abril de 2007,[4][5][6][7][8] pero sigue activo en el desarrollo de herramientas para Wikipedia[9] y sus proyectos hermanos Wikidata y Wikimedia Commons.
[12][18] Manske es partidario del código abierto, más específicamente de la licencia GPL.
Manske es reconocido como el creador en 2001 del primer artículo en la Wikipedia alemana, sobre la reacción en cadena de la polimerasa.
[23][24][25] En 2002, Jimmy Wales nombró el 25 de enero como Día de Magnus Manske en honor a sus contribuciones a la Wikipedia, proclamando que «esta noche en la cena, todos los wikipedistas deben brindar por Magnus y sus muchos inventos».