Es endémico de Guanajuato, Querétaro y San Luis Potosí en México.
Mammillaria muehlenpfordtii es una planta suculenta esférica, para dicotómica que tiende a la división.
Mammillaria muehlenpfordtii fue descrita por Michael Joseph François Scheidweiler y publicado en Allgemeine Gartenzeitung 15: 49.
[1][2] Mammillaria: nombre genérico que fue descrita por vez primera por Carolus Linnaeus como Cactus mammillaris en 1753, nombre derivado del latín mammilla = tubérculo, en alusión a los tubérculos que son una de las características del género.
muehlenpfordtii: epíteto otorgado en honor del botánico Friedrich Mühlenpfordt.