Su rendimiento mejoró levemente en la temporada 2005-06, en la que disputó 29 encuentros y convirtió 7 goles, con el equipo terminando en 7.º lugar.
En su primer año, Heidenheim alcanzó la 6.ª posición, acabando sólo cinco unidades del tercer puesto —último lugar para el ascenso—.
Las primeras fechas otorgaron un panorama promisorio para el Heidenheim: en cuatro jornadas, el equipo se mantenía líder con tres victorias y un empates.
Schnatterer fue, justamente, protagonista principal de aquel arranque ilusionador, al convertir en todos los encuentros.
Al igual que en la temporada previa, el equipo terminó a un punto del tercero, compartiendo la cuarta posición con Preußen Münster.
El nivel de Schnatterer no disminuyó en el siguiente campeonato, que dictaminó el esperado ascenso a la 2.
Al igual que en las temporadas previas y con la cinta de capitán en su manga, el delantero se consagró como pieza fundamental del equipo.
[8] Schnatterer jugó todos los encuentros de liga como titular, fue reemplazado sólo siete veces y convirtió 13 tantos.