Marco Antonio Auli Niño fue hijo extramatrimonial de Benito Auli Mancilla y de Leonarda Niño Rodríguez, al igual que su hermano Benito.
Contrajo primeras nupcias con María Luisa Price y por segunda vez con Inés Martínez Delgado.
Fundador de una exitosa empresa molinera en Sogamoso, Auli residió varios años en este municipio.
Adquirió en 1921 El Diario Nacional al expresidente Jorge Holguín, en compañía de Alfonso López Pumarejo y Luis Samper Sordo, empresa que gerenció pero que no tuvo éxito, al ser una tribuna liberal inconforme con la prevalente visión política del general Benjamín Herrera.
En 1943 fue el primer gerente del Banco Postal Nacional.