Marcos Farfán (Cuzco, fines del siglo XVIII-siglo XIX) fue un clérigo y político peruano.
Fue presidente de la Convención Nacional o Congreso Constituyente en 1834.
[1][2] En las elecciones de 1825 para el Congreso (que se regía por el sistema de los Colegios Electorales) fue elegido diputado por Cuzco, pero debido a la injerencia de Bolívar, que no quería diputados liberales, no llegó a ser calificado.
Y de mayo a junio del mismo año ejerció la presidencia.
Durante la guerra desatada por la invasión boliviana dirigida por Andrés de Santa Cruz, fue desterrado por este caudillo, debido a su simpatía por el general Agustín Gamarra, el cual, junto con Felipe Santiago Salaverry, encabezaba la defensa del Perú.