[2][3] En 1544, a temprana edad ya que tenía 11 años, y junto a su hermano Juan, fueron enviados durante seis años a la universidad de París para cursar estudios de griego, ciencias exactas, físicas y naturales así como de ciencias matemáticas, geografía y astronomía.
Martín y Juan acabarían su formación en la Universidad de Salamanca, debido a las guerras de religión entre católicos y protestantes acontecidas en Francia.
Martín de Rada mostró, basándose en el libro De revolutionibus orbium coelestium, de Copérnico, que las Filipinas eran españolas (aunque posteriormente se sabría que, según el tratado, correspondían a Portugal).
[7] Las Islas Filipinas fueron colonizadas por España, y el peso de los clérigos fue incluso superior al que alcanzaron en la colonización americana, destacando la presencia de los llamados Agustinos Filipinos (desde 1565).
Con base en su experiencia en las tierras chinas, Rada llegó a proponer una conquista española de China que nunca llegó a realizarse.