Se mostró escéptico respecto a muchos de los contenidos presentes en los Evangelios, postulando su carácter ficticio.
En 1567 confesó al rector que «había un punto en la doctrina [cristiana] que no podía adoptar», y en octubre del año siguiente el consejo eclesiástico solicitó su destitución por profesar creencias "arrianas" y negar la autoridad del Nuevo Testamento; el rector ordenó una investigación, aunque cuatro años más tarde Seidel continuaba como preceptor.
Seidel manifestó su intención de no volver a Heidelberg y mandó un escrito al profesorado de su antigua universidad que fue destruido, dado su contenido polémico (considerado un "escrito blasfemo") precursor del posterior Origo.
[3] Más tarde se refugió en Polonia, asociado con los sabatarios sículos, que pertenecían al movimiento unitario de Transilvania y a quienes Socino caracterizó como "semijudaizantes".
[4] En 1611 publicó Miscellanea; hoc est, Scripta theologica seu tractatus breves de vidersis junto a Jan Niemojewski.